В модуле Drupal Taxonomy Menu, предназначенном для вывода какого-либо раздела таксономии в виде меню, есть не очень очевидная возможность разнести созданные меню по отдельным блокам. Из-за этой самой неочевидности я даже писал модуль, который делает это программно.

Итак, наши действия

1. Загружаем модуль, ставим.
2. Выбираем нужные разделы таксономии (admin/settings/taxonomy_menu).
3. Чистим кэш (модулем Devel или из настроек производительности).
4. Идём в администрирование меню (admin/build/menu). Тут в блоке navigation должны появится наши нагенерённые из таксономии меню.
5. Создаём новые меню, перемещаем туда нужные нам пункты из блока navigation.
6. Идём в настройки блоков (admin/build/block). Помещаем появившиеся там блоки-меню в нужные нам регионы.