Скорее, ему не нравится что он ожидает наличия файлов во временной директории, а ее нет, т.к. нет прав на ее создание, т.к. на корень сайта вряд ли кто даст права на запись.

Т.е. вариант - создать временную папку в установленном положении, и дать права на ее использование, попутно установить нужные пермишны на остальные директории и проверить решилась ли проблема.