Здравствуйте.
1) Можно ли фильтры разместить не над содержимым на странице, а допустим в боковой колонке (контейнере) справа/слева на сайте?
2) Где фильтры можно оформить (цвет и т.д.) ,в каком файле копать?
3) Можно ли фильтр превратить (и как) в чекбокс?
Комментарии
1)можно, во вьюсе настраиваете отображение фильтра в блоке, а сам блок выводите в нужный регион.
2)скорее всего это style.css вашей темы оформления. или любой файл с расширением css в вашей теме оформления.
3)в настройках фильтра отмечаете чекбокс "Множественные значения" и готово. поставьте также bef будет больше настроек.