Столкнулся с такой проблемой в 6 версии друпала (в 5 работало все как надо :)).
Не присваевается класс active для родительского меню, когда находишься в его подменю.
Просмотр документации (http://drupal.org/node/44711) по это вопросу и разобранные там примеры не дали результата
Решил проблему таким образом сделал свою функцию phptemplate_links, код для которой взял из исходной финуции http://api.drupal.org/api/function/theme_links/6, добавив туда следующий код перед формированием самой ссылки т.е. тепед вызовом функции l http://api.drupal.org/api/function/l/6