О! Решил проблему. Такая штука происходит, если стоит версия PHP 5.3. Поставил 5.6 и цены появились и в админке, а в дальнейшем и в материалах с прикрепленными товарами, которые необходимо пересохранить! Сам товар пересохранять не нужно.

Так что, проблема, почему не отображаются значения больше 999 в рублях, можно сказать решена.

IgSi wrote:

Да, меньше тысячи выводит. Ставил 999, и показывалось, а 1000 уже нет. Доллары выводит, и больше 1000, и меньше.

Подтверждаю. У меня точно такая же история. Где искать - ума не приложу.
Причем, в самом товаре цена сохраняется, но уже когда в админке смотришь на список товаров, вместо цены только атрибут валюты - Р. И все.