Судя по всему, универсального метода решения нет. Причиной тому, скорее всего, является
не одна какая-то конкретная проблема, а наложение и переплетение разных обстоятельств.

Да! Спасибо.

Последние вести с фронта борьбы с несохраняющимися галочками и другими параметрами:
Решено методом грубой силы (всё снесено и установлено заново).
Отсюда выводы (может быть полезно для будущих воинов):
Проблемы были внутри Drupal (по крайней мере 7.10)
Дело в том, что переустановлено буквально то же самое. Я сузил круг подозреваемых
до своей собственной темы, но дело не в ней. Она была без изменений установлена в новую
систему и всё пошло без проблем.
Другими словами, в Drupal можно выполнить какое-то необратимое действие, которое

"VasyOK" wrote:

update.php делали?

Сделал. Не помогло.

"Niklan" wrote:

Мне помогло отключение модуля Rules

Проверил этот совет: модуля Rules нет в списке модулей.
Может быть в версии 7.10 и не должно быть такого модуля...

Честно говоря, не уловил момента "слёта". Делал обычную установку, потом поставил
CKEditor, потом повозился с отладкой своей темы. Потом, предвкушая скорое завершение,
решил поставить пару галочек на права пользователя и обнаружил, что галочки не ставятся.
Про "раньше работало?" могу сказать, что галочки определённо ставились как минимум
на этапе установки CKEditor (там же нужно пару галок поставить, а CKEditor у меня
заработал).
Вроде бы все претензии сводятся к "моей простенькой теме". Может быть...