Из-за своей привычки помещать проекты в каталог test1.ru Денвера столкнулся с не слишком распространенной, но неприятной проблемой: в Eclipse PHP с установленным в Денвере ZendDebugger в режиме Web Pages не работали точки останова.

Вот ссылка на англоязычное решение: tried moving my project's files all into the root folder of the web server (just dummy.php in this case.) I modified my "Dummy Debugger Test Server" configuration as shown in this screenshot:... It worked

Для себя я решил проблему так:
1) Eclipse PHP Server - http://localhost;
2) все проекты кладутся в папки денвера home/localhost/project1, home/localhost/project2;