Почитав тему, задался вопросом и нашел на него ответ )

Обновление ядра Drupal с помощью Drush

1. Перевел сайт в режим обслуживания:

• drush vset maintenance_mode 1

2. Отключаем все активные модули модули не из ядра:

• drush pml --no-core --type=module --status=enabled --pipe | xargs drush -y dis

3. Запускаю обновление (проверяются все модули и ядро), после предложения обновить нажимаем "Y"

• drush up

4. Запускаем updete.php и очищаем все кэши