Опция -q при дёрганьи wget'ом точно должа помочь. У самого была такая проблема, оказалось, что это фича wget. Он просто сохраняет страницу, которую выгреб, а если страница с данным именем уже существует, приплючоввывает счетчик в конец. Посему, как и сказал товарищ Dan, используйте -q в параметрах wget
wget -q http://www.ВашСайт.ru/cron.php