Проблема с этой папкой не в правах, а во владельце - по умолчанию для нее выставлен Apache, соответственно никто кроме него и удалить ее не может. Соответственно, чтобы эту возможность получить достаточно сбросить это значение - насчет того, можно ли это сделать через тотал не скажу, а вот через файлменеджер ДА делается легко.