За форматирование результатов поиска (втч и выделение жирным) отвечает функция search_excerpt, входящая в состав модуля search. Я не вижу способа перегрузить ее, так что, похоже, единственный способ - вносить изменения непосредственно в модуль search.
Если хотите, можете загрузить исправленный модуль search, на свой страх и риск у меня работает

Проверил - действительно, у меня поиск тоже не всегда работает корректно.

А вы не забыли переиндексировать содержимое сайта?