Проблема решилась. Была загвоздка именно в версии Друпала, после обновления до последней версии все заработало. Тема закрыта.

Я пробовал, и пробовал на самой таксономии настраивать, тоже самое. Пробовал настраивать по полю список, пробовал по полю таксономия. Сам уже давно работаю на Друпале. но на 7. А тут проект попался на 8, проблема в том что его начинал делать не я и возможно что-то изменяли, но сам модуль ставил я и пробовал другие версии ставить.

Само представление http://skrinshoter.ru/s/220617/ULSLAUkx?a и оно работает без чек-боксов нормально, то есть если не выставлять чек-боксы и при это ничего не выбирать то показывается все. То есть проблема именно в этом, пробовал и таксономию и просто списком выборочным делать и там и там одно и тоже.
Сам раскрытый фильтр стандартный, причем делаю все подобного же плана на другом сайте который на 7, все в норме. http://skrinshoter.ru/s/220617/iq6rVjnu?a