Нужно оформить пункты меню в зависимости от уровня вложенности. Собственно проблема состояла в поиске этого самого уровня. Как оказалось спустя несколько часов ничего искать не надо, все уже давно найдено:
<?php
function THEMENAME_menu_link(array $variables) {
$element = $variables['element'];
$sub_menu = '';
$element['#attributes']['class'][] = 'level-' . $element['#original_link']['depth'];
if (
$element['#below']) {
$sub_menu = drupal_render($element['#below']);
}
$output = l($element['#title'], $element['#href'], $element['#localized_options']);
return '<li' . drupal_attributes($element['#attributes']) . '>' . $output . $sub_menu . "</li>\n";
}
?>