зависит от количества функционала, бюджета и целей
Друпал 6.х - более проверенный, имеет кучу готовых модулей, но через год поддержка будет уменьшатся и переключаться на 7.х, мигрировать будет тоже не легкая задача как мне кажется
Друпал 7.х — крутой и более навороченный, но пока не все модули есть в наличии