Перепроверить настройки.

В настройках редактора admin/settings/bueditor/1
Visibility settings -> Hide the editor for specific textareas
удалить строчку edit-comment

2 Stutzer, если Вы не переопределяли пути по умолчанию, то
node/* - если форма под нодой
comment/* - если форма на отдельной странице
должно работать (только что проверил), если переопределяли пути, то должно быть:
путь-где-находится-форма-комментирования/*
Проверял на версии 6.*
Если не заработает, но очень нужно, можно поставить "свежий" Друпал и установить только 1 модуль BUEditor, если опять не работает - хз. Если заработает, то в "рабочем" Друпале где-то конфликт, может между модулями - пробуетие отключать по одному и смотреть...

P.S. если найдете причину, желательно здесь отписаться, что там было...

После обновления слетели частично конфиги bueditor а именно права на использование, пути.
И с какого-то перепугу он перестал появляться в формах комментария.
Всё ж было настроено, работало нормально. Еще обновление сырое красным раскрасили, если бы желтым сделали, я и обновлять бы не стал.

Косяк нашел. BUEditor теперь не дружит с оптимальным режимом WEBOptimizer. В безопасном заработало.