"столкнулся с той же самой проблемой (нет кнопок "Посмотреть на сервере") - в итоге постоветовали все переставить, показали мануал, который перечитал уже 100 раз. в итоге просто отказался от Fckeditor и поставил менее удобный tinymce...
Если все же у Вас получится поборость эту проблему - подскажите решение. Спасибо."

"Управление" - "Настройка" - "FCKeditor" - Дальше профиль которым вы пользуетесь(я все удалил и пользуюсь только "Default") нажимаем "Изменить" - Там менюшка "Настройки обзора файлов" - "Разрешить базовое управление файлами: " ставим "истина" и в другом случае также, если конечно надо, ну и соответственно пути прописываем. (все описанно для руско язычной версии, для англо также только на английском контексте) - это для того чтобы грузить изображения
А еще придется залезть в ваш_сайт\modules\fckeditor\fckeditor\editor\filemanager\connectors\php\ в файл config.php и в 30 строчке "$Config['Enabled'] = false ;" false поменять на true , в итоге должно получиться так:
$Config['Enabled'] = true ; - это для того чтобы работала кнопока "Посмотреть на сервере"

Собственно все должно работать.

Про папки вопрос остается актуальным!