В особенностях модуля написано "Uses the default taxonomy term path or custom paths" и "Integrate with Pathauto: use URL/path aliases" https://www.drupal.org/project/taxonomy_menu

Т.е. в шаблоне Pathauto я могу использовать свой пользовательский путь, синоним URL термина таксономии или нет?
Если да, то как называется этот токен?

Чтобы пути терминов оставались на английском языке, как я их написала в синониме URL термина, а не транслитом.
Чтобы был шаблон - пользовательский синоним URL термина и заголовок ноды, но заголовок уже транслитом.