Посмотрела модуль relativity для организации связи между объектами - в сочетании с flexinode почти та функциональность, что мне нужна. Пожалуй, большинстве стандартных случаев такой связки будет достаточно, но у меня ситуация, когда объекты одного типа могут иметь с объектами другого типа связи разного типа (что делать с тем, что слово "типа" три раза повторяется в этом предложении, я не знаю :)).

Конкретнее - есть проекты и есть организации. Организация может относиться к проекту как клиент, для которого проект выполнялся, а может - как партнер, участвовавший в проекте. Теоретически можно создать некие псевдообъекты "Связь проект-клиент-организация" и "Связь проект-партнер-организация", и дальше уже связывать организации и проекты через них, но как-то это некрасиво. Будем думать дальше.