К сожалению, я не имею достаточного опыта работы с nic.ru.

А теперь детальнее:
Для Apache и lightthttpd:
Режим FastCGI более безопасен, но немного менее производителен, по сравнению с mod_php.

Лично я рекомендую его включать только на Windows-хостинге для новейших серверов IIS.

Существует ещё один интересный вариант - это использовать сервер nginx с поддержкой FastCGI, вместо Apache.

Эта связка наиболее быстра. Вообще, её можно рекомендовать, если ваши скрипты не ходят куда-то далеко, а все данные получают локально или по локальной сети.

Наиболее универсальный и часто более совместимый вариант, это использование nginx в режиме forwarding proxy и Apache+modphp в качестве backend. На ваших серверах я очень рекомендую использовать именно такую конфигурацию.