Вообщем, чтобы корзина заработала необходимо зайти в папку с модулем на сервере и открыть файл uc_ajax_cart.js, далее найти строку которая навешивает класс на саму кнопку корзины, а именно
jQuery('form.ajax-cart-submit-form input.ajax-cart-submit-form-button').not('.ajax-cart-processed, #edit-update').each(function () {

и заменить на следующий
jQuery('form.ajax-cart-submit-form button.ajax-cart-submit-form-button').not('.ajax-cart-processed, #edit-update').each(function () {
Вообщем все просто

С учетом если тег input[type="submit"] был изменен button