Нигде они не хранятся. Модуль генерирует его при нажатии кнопки по факту того, что есть в коде и что переведено в базе и предлагает сохранить этот файл на комп. Куда угодно, главное не в корзину)) Открываешь файл и редактируешь, а потом импортируешь его в друпал. Если меняешь существующие переводы, то нужно выставить соответствующую галочку при импорте.

Сам этот файл хранить надо только в том случае, если модуль самописный, тогда в папке модуля надо создать папку translations и положить этот файл туда, чтобы при установке этого модуля на другой сайт этот перевод импортировался автоматически.