Если слетает кодировка после работы крона, то проблема не в кроне как таковом, а в модулях, которые посредством него вызываются. Значит какой-то из модулей работает так некорректно - поотключать дополнительные модули, посмотреть как будет работать. С базовыми модулями проблем быть не должно - если проблемы сохранятся, что-то принципиально не так с установкой движка.

В .htaccess на всякий случай можно добавить AddDefaultCharset utf8 - хуже не будет. См. также: http://www.drupal.ru/node/1830

--
Администратор сайта «Drupal — Россия»
на вопросы по Drupal отвечаю только на форумах, не пишите в почту и приватом!